動物所從單細胞水平揭示造血干細胞擴增的動態(tài)圖譜
造血干細胞具有自我更新和分化的生物學特征,既可以維持其自身在造血組織中的恒定數(shù)量,又能向紅系、粒系、巨核系和淋巴系等多種血細胞分化。造血干細胞移植廣泛應用于白血病、再生障礙性貧血、骨髓增生異常綜合征等臨床血液系統(tǒng)惡性腫瘤的治療,然而,造血干細胞來源不足,限制其廣泛應用。因此,如何模擬體內(nèi)造血干細胞擴增并實現(xiàn)臨床轉(zhuǎn)化應用備受關(guān)注。
斑馬魚造血干/祖細胞(Hematopoietic stem/progenitor cells,HSPCs)擴增和分化的重要場所是尾部造血組織(Caudal hematopoietic tissue,CHT)。CHT是高度血管化的微環(huán)境結(jié)構(gòu),包括尾部主動脈、尾部主靜脈、尾部靜脈血管叢(Caudal vein plexus,CVP)以及大量的成纖維網(wǎng)狀細胞和多種血細胞。其中,各個組分的有序及精細的調(diào)控對微環(huán)境的穩(wěn)態(tài)維持至關(guān)重要。中國科學院動物研究所劉峰研究組前期已利用多維多重轉(zhuǎn)錄組技術(shù),系統(tǒng)闡釋了造血干細胞和微環(huán)境細胞之間的分子調(diào)控網(wǎng)絡。然而,對造血干細胞擴增和分化的時間區(qū)段內(nèi),血管微環(huán)境的細胞復雜性、功能可塑性及動態(tài)協(xié)同發(fā)育過程的研究較為有限。
3月30日,劉峰研究組在PNAS上發(fā)表研究論文A single-cell resolution developmental atlas of hematopoietic stem and progenitor cell expansion in zebrafish。該研究描繪了擴增性造血組織的動態(tài)單細胞發(fā)育圖譜,深入解析了造血干細胞擴增的細胞基礎和分子機制。
利用單細胞轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù),研究選取3個造血干細胞發(fā)育的重要時間點(55hpf、3.5hpf、4.5hpf)對斑馬魚尾部造血組織28777個細胞(包含HSPCs、內(nèi)皮細胞及非內(nèi)皮/HSPCs細胞)進行深入分析。首先,研究鑒定出斑馬魚尾部造血組織不同分化傾向性的HSPCs和各譜系血細胞。其次,通過對CHT微環(huán)境成分的深入解析,研究發(fā)現(xiàn)CHT存在動態(tài)發(fā)育過程,即微環(huán)境細胞協(xié)同HSPCs發(fā)育。研究還鑒定了一群特殊的促擴增內(nèi)皮細胞和其特異的微環(huán)境因子Gpr182。斑馬魚體內(nèi)功能實驗證明,Gpr182可以促進HSPCs在尾部造血組織的擴增,并且Gpr182的功能在小鼠中是保守的。最后,通過將斑馬魚尾部造血組織和人胎肝的單細胞數(shù)據(jù)進行比對分析,研究發(fā)現(xiàn)二者在進化上具有保守的細胞類群基因表達,而其差異性則體現(xiàn)在細胞類型組成和HSPC的轉(zhuǎn)錄組特征,即斑馬魚的擴增性造血組織的HSPC更能適應溫度變化,人胎肝中的HSPC具有更強的免疫特征。上述結(jié)果暗示了造血干細胞對環(huán)境的適性進化。
該研究對斑馬魚擴增性造血組織的動態(tài)發(fā)育、造血干細胞擴增的細胞學基礎提出了更有深度的理解,為HSPCs的體外高效擴增提供了新的理論指導。
單細胞轉(zhuǎn)錄組測序解析斑馬魚尾部造血組織。在3個造血干細胞發(fā)育的重要時間點(55hpf、3.5hpf、4.5hpf)對尾部造血組織的細胞(包含造血干/祖細胞、內(nèi)皮細胞及非內(nèi)皮造血干/祖細胞)進行深入分析。從中鑒定了不同分化潛能的造血干/祖細胞,建立了復雜有序的微環(huán)境細胞和HSPC的互作網(wǎng)絡,發(fā)現(xiàn)了一群特殊的促擴增內(nèi)皮細胞和特異表達因子Gpr182。通過對斑馬魚尾部造血組織和人胎肝造血發(fā)育的進化分析,發(fā)現(xiàn)了造血干細胞在不同物種中的轉(zhuǎn)錄組特征存在異同。
來源:中科院

