2022年12月28-30日·北京·計算機輔助藥物設計(CADD)——蛋白質(zhì)分子對接和網(wǎng)絡互作研討班
生命活動的基礎是生物分子間以及生物分子與其它分子間的相互作用,主要包括蛋白質(zhì)-小分子、蛋白-蛋白相互作用、蛋白-核酸相互作用等。研究生物分子間的相互作用,可以從分子水平上了解生命現(xiàn)象,從而闡明生命活動的機理,發(fā)現(xiàn)致病機制、治療途徑以及新藥研發(fā),具有非常重要的理論和現(xiàn)實意義。隨著生物分子相互作用實驗技術平臺的發(fā)展,積累了大量的分子互作實驗數(shù)據(jù),如何分析和處理這些數(shù)據(jù)成為關鍵。目前,用生物信息學的手段來研究生物分子相互作用顯示出巨大的優(yōu)勢,技術工具更替升級的速度也越來越快。對從事基礎研究的人員來說,迫切需要學習掌握生物信息學,生物分子互作等新工具,才有機會在科研競爭中占據(jù)優(yōu)勢。虛擬篩選是計算機輔助藥物設計中十分重要的技術手段,能夠從千萬量級的化合物數(shù)據(jù)庫中迅速篩選潛在的Hits,大大縮短發(fā)現(xiàn)先導藥物的時間。經(jīng)過多年的技術迭代,虛擬篩選領域積累了豐富的數(shù)據(jù)庫和軟件,我們的課程從理論到實際操作完美結(jié)合,讓各位充分掌握相關軟件操作的關鍵點。
授課對象:有生物分子互作分析需求的或者希望深入了解并掌握生物分子互作生物信息學分析數(shù)據(jù)庫及工具的研究生、科研工作者。
學員基礎:由于培訓具備一定的深度和廣度,我們希望學員應具有學習生物分子互作軟件的興趣、基本的生物概念和相關基礎知識。
電腦要求:64位windows10操作系統(tǒng),運行日常程序流暢。
主辦單位:北京市計算中心有限公司
協(xié)辦單位:
北京市基因測序與功能分析工程技術研究中心
云計算關鍵技術與應用北京市重點實驗室
工業(yè)和信息化人才培養(yǎng)工程培訓基地
北京市大數(shù)據(jù)教學實踐基地
支持單位:肽度TIMEDOO
舉 辦 地:北京市海淀區(qū)豐賢中路7號北科產(chǎn)業(yè)3號樓
課程安排:2022.12.28-30(周三-周五) ?上9:30-11:30 ?下13:30-17:00
日期 | 主題 | 內(nèi)容 | 備注 |
第一天 | 生物分子互作概述 | 1.生物分子相互作用概述
2.虛擬篩選:生物分子相互作用在計算機輔助藥物設計方面的應用 |
理論+實戰(zhàn) |
基因信息和分子結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫 | 1.PDB:蛋白結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫及結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)的篩選和獲取
2.NCBI:生物信息綜合數(shù)據(jù)庫查詢和數(shù)據(jù)獲取 |
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生物網(wǎng)絡和疾病相關數(shù)據(jù)庫 | 1.IPA:臨床組學及藥物數(shù)據(jù)挖掘
2.OMIM:人類疾病與基因遺傳變異數(shù)據(jù)庫 3.KEGG:細胞代謝及信號傳導通路數(shù)據(jù)庫 4.STRING:蛋白質(zhì)互作網(wǎng)絡查詢和可視化分析 |
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第二天 | 分子網(wǎng)絡分析及可視化實戰(zhàn) | 1.Cytoscape:網(wǎng)絡分析軟件
2.生物分子交互作用復雜網(wǎng)絡可視化 3.生物分子網(wǎng)絡靶點分析、網(wǎng)絡聚類分析 4.網(wǎng)絡藥理學論文實例概述 |
理論+實戰(zhàn) |
分子結(jié)構(gòu)可視化軟件SCI繪圖實戰(zhàn) | 1.Pymol分子結(jié)構(gòu)可視化軟件
2.分子結(jié)構(gòu)文件處理和計算 3.生物大分子靶點結(jié)構(gòu)分析及高質(zhì)量論文繪圖 |
理論+實戰(zhàn) | |
第三天 | 蛋白質(zhì)靶點和小分子對接實戰(zhàn) | 1.Autodock軟件原理及功能介紹
2.分子對接和對接結(jié)果分析 3.實例講解與練習 |
理論+實戰(zhàn) |
虛擬篩選演示與實戰(zhàn) | 1.基于高性能計算集群的藥物虛擬篩選概述2.ZINC:虛擬篩選小分子數(shù)據(jù)庫介紹與應用
3.Autodock vina軟件原理及功能介紹 4.實例講解與練習 5.Linux介紹及高性能計算虛擬篩選操作演示 |
理論+實戰(zhàn) | |
生物分子互作網(wǎng)絡分析繪圖及網(wǎng)絡藥理學介紹 | 1.大分子對接原理及應用介紹
2.Rosetta軟件介紹與使用 3.z-dock軟件介紹與使用 4.實例講解與練習 |
理論+實戰(zhàn) |
注:內(nèi)容以實際發(fā)生為準;若調(diào),會提前通知。
【報名費用】
注冊費:4200元/人(含當期聽課費、資料費、證書費、考試費(如有))。
提供當期視頻回放以供復習使用(羽林學院平臺)。
開具增值稅發(fā)票,提供蓋章通知、結(jié)業(yè)證書等相關材料。
【報名優(yōu)惠政策】
1、3人以上團體報名每人可減少300元;
2、4+1團報,可免費贈送一個名額;
3、上面優(yōu)惠政策不能同時享受,只能享受其中一種;
老學員參加及推薦學員參加均可額外優(yōu)惠200元。
【付費方式】
手機銀行或電子銀行轉(zhuǎn)賬、銀行匯款等
單位全稱:北京市計算中心有限公司
賬號:0200151819100023937
開戶銀行:中國工商銀行股份有限公司北京自貿(mào)試驗區(qū)永豐基地支行
(匯款信息備注:“智能計算——您的姓名”,個人匯款請備注單位名稱)
注:款項支出后,請?zhí)峁└犊罨貓?zhí)給工作人員,方便核實到賬、開具發(fā)票。
【咨詢請聯(lián)系】
QQ號:659230635
微信號:vicolee2021
【注】開課前一周會發(fā)送郵件通知;若未接到郵件通知,請電話咨詢。


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