研究揭示促癌基因NEAT1抑制白血病發(fā)生和發(fā)展
10月5日,中國科學院生物物理研究所研究員卜鵬程課題組與解放軍總醫(yī)院第五醫(yī)學中心教授胡亮釘團隊合作,在Advanced Science上發(fā)表了題為Cytoplasmic NEAT1 Suppresses AML Stem Cell Self-Renewal and Leukemogenesis through Inactivation of Wnt Signaling的論文。該研究首次發(fā)現實體瘤中被認為是促癌基因的長鏈非編碼RNA NEAT1(Nuclear Enriched Abundant Transcript1)通過抑制急性髓系白血病(Acute Myeloid Leukemia, AML)自我更新,抑制AML的發(fā)生和發(fā)展。研究發(fā)現,定位于旁斑中的NEAT1從細胞核穿梭到細胞質中,與Wnt通路接頭蛋白DVL2和E3泛素化連接酶Trim56結合,促進DVL2降解,抑制Wnt信號通路,進而抑制AML干細胞的自我更新。
AML是髓系前體細胞中系列染色體易位和基因突變導致的,AML患者間存在極強的異質性,臨床上針對不同的AML發(fā)病機理采取不同的治療方法,仍有許多AML亞型尚無有效的靶向藥物,且已有的靶向藥物對發(fā)病機理復雜的患者療效不顯著,探究AML調控新機制,探索靶向不同類型AML的普適靶點是AML研究中亟待解決的問題。
LncRNA NEAT1是細胞核中亞細胞結構旁斑的重要組成元件,具有NEAT1_1(3.7Kb)和NEAT1_2(23Kb)兩種亞型,關于NEAT1_2的研究較多,作為旁斑的骨架,在旁斑的構建和mRNA的出核中發(fā)揮重要作用,在肝細胞肝癌、胃癌、結直腸癌和神經膠質瘤等實體瘤中均被認為是促進腫瘤細胞增殖、轉移和耐藥的促癌基因。然而,卜鵬程課題組發(fā)現,NEAT1在AML骨髓細胞中的表達顯著低于正常骨髓細胞,且NEAT1能有效抑制FLT-ITD3、MLL-AF9和HOXA9/Meisl三種AML亞型的發(fā)展。進一步研究發(fā)現,細胞質中的NEAT1_1通過調控Wnt信號通路,抑制AML干細胞的自我更新、促進細胞分化。
研究分析TCGA和GEO數據庫發(fā)現,NEAT1在AML細胞中的表達顯著低于正常血液細胞,且與AML患者的復發(fā)期呈正相關,即NEAT1表達越低的患者復發(fā)期越短。為了剖析NEAT1不同亞型在AML中的表達情況,科研究人員根據NEAT1_1和NEAT1_2的序列特征,即二者具有相同的5’端和不同的3’端序列,設計并合成了分別靶向總NEAT1和只靶向NEAT1_2的檢測探針,并與胡亮釘團隊合作收集了大量的健康人群、初治和復發(fā)AML患者的骨髓樣本,檢測證實了NEAT1_1和NEAT1_2均在健康、初治和復發(fā)AML患者的骨髓細胞中的表達依次降低,且在AML干細胞中的表達明顯低于非干細胞。研究在RNA FISH染色中發(fā)現與NEAT1_2限制性定位于細胞核不同,部分NEAT1定位于細胞質中,且在非干細胞中的表達顯著高于干細胞,推測這部分定位于細胞質中的是NEAT1_1。進一步核質分離檢測證明NEAT1_1在AML細胞中發(fā)生細胞核到細胞質的轉移,且在分化的AML細胞質中累積增多。體外AML細胞中敲低NEAT1_1促進細胞成克隆和增殖,抑制細胞分化和凋亡。研究分別利用兩例初治和復發(fā)患者的AML細胞構建了PDX模型,發(fā)現無論是初治還是復發(fā)患者來源的AML細胞,敲低NEAT1_1均能促進AML細胞在骨髓、脾臟和外周血中的浸潤,顯著縮短小鼠的存活時間。研究人員還分別構建了FLT-ITD3、MLL-AF9和HOXA9/Meisl三種亞型的AML小鼠,發(fā)現NEAT1_1通過抑制骨髓中AML細胞自我更新和增殖,抑制AML細胞向外周組織浸潤,進而抑制AML的發(fā)展。進一步研究發(fā)現,AML干細胞分化過程中,轉錄因子C/EBPβ表達上調和核定位蛋白NAP1L1的表達下調是調控NEAT1_1出核的關鍵。機制研究表明,細胞質中的NEAT1_1與Wnt信號通路的接頭蛋白DVL2和E3泛素化連接酶Trim56結合,降解DVL2,抑制Wnt信號通路的激活。
該研究發(fā)現了實體瘤中的促癌基因NEAT1在AML中具有抑癌功能,揭示了NEAT1_1出核新機制,為AML靶向治療提供理論依據。研究工作得到科技部、國家自然科學基金委和中科院的支持。
NEAT1在實體瘤和AML中通過不同的作用機制,分別發(fā)揮促癌和抑癌功能
來源: 生物物理研究所


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