還在認為沒有實驗就不能發(fā)表論文?

手頭有很多數(shù)據(jù),不知道該怎么進一步挖掘?

還在為不知道如何找靶點而苦惱?

還在為不精通挖掘GEO、TCGA等數(shù)據(jù)庫而痛苦不堪?

還在為不會那些高大上的圖表而暗自傷神?

快來參加北京市計算中心舉辦的生物醫(yī)學(xué)公共數(shù)據(jù)深度挖掘及應(yīng)用培訓(xùn)班吧!

本次培訓(xùn)對目前公共數(shù)據(jù)挖掘熱點進行系統(tǒng)介紹,提供一次系統(tǒng)了解TCGA、GEO、SRA、ENCODE等數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)產(chǎn)生、分析及挖掘的課程。通過大量演練操作,幫助科研人員利用這些公共數(shù)據(jù)庫挖掘多組學(xué)數(shù)據(jù),以便為自身科研項目服務(wù)。歡迎報名參加。更多消息可關(guān)注“生信會議”公眾號,會給您帶來更多驚喜!

授課對象:

從事生物醫(yī)學(xué)研究的臨床醫(yī)生、轉(zhuǎn)化研究科研人員;

課題經(jīng)費不足,無法進行大規(guī)模測序,但需要發(fā)表SCI論文的相關(guān)研究人員;

已獲得轉(zhuǎn)錄組、基因組等多組學(xué)數(shù)據(jù),需要進一步挖掘分析人員;

對生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)分析與挖掘感興趣的其他人員。

培訓(xùn)效果:

短、平、快,為基金申請保駕護航,發(fā)表paper如虎添翼;

掌握多組學(xué)數(shù)據(jù)分析核心技能,GEO、TCGA、SRA數(shù)據(jù)處理沒有壓力;

科研繪圖:以一敵百,高端大氣,私人訂制;

一套數(shù)據(jù)多角度演練,更易掌握分析思路。

主辦單位:北京市計算中心有限公司

協(xié)辦單位:北京市基因測序與功能分析工程技術(shù)研究中心

云計算關(guān)鍵技術(shù)與應(yīng)用北京市重點實驗室

工業(yè)和信息化人才培養(yǎng)工程培訓(xùn)基地

北京市大數(shù)據(jù)教學(xué)實踐基地

舉 辦 地:北京市海淀區(qū)豐賢中路7號北科產(chǎn)業(yè)3號樓

課程安排:2022年6月14日-17日(周二–周五) 上午9:30-11:30 ?下午13:30-17:00

時間 主題 授課內(nèi)容 備注
第一天 組學(xué)及生物信息學(xué)概述 1、組學(xué)研究概述(基因組學(xué),轉(zhuǎn)錄組學(xué),表觀組學(xué),蛋白質(zhì)組學(xué),代謝組學(xué)及相關(guān)技術(shù)介紹)
2、實驗設(shè)計及測序原理
3、生物信息學(xué)背景知識介紹
理論
公共數(shù)據(jù)庫挖掘熱點介紹 4、人工智能研究在病理切片識別上的應(yīng)用
5、人工智能多組學(xué)數(shù)據(jù)整合分析
理論
常用生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫介紹 6、用生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫介紹:
(1)大型綜合數(shù)據(jù)庫:NCBI、UCSC
(2)公共高通量測序數(shù)據(jù)庫:SRA
(3)公共基因表達譜數(shù)據(jù)庫:GEO
(4)公共癌癥多組學(xué)數(shù)據(jù)庫:TCGA
7、各大數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)下載
理論+演示
第二天 R語言入門 8、R語言簡介
9、R語言安裝及配置
10、R語言數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)
11、R語言數(shù)據(jù)處理
12、R語言繪圖
理論+實操
基于公共數(shù)據(jù)的Biomarker挖掘鑒定演練(一) 13、差異表達分析及結(jié)果可視化:
(1)edgeR包使用
(2)火山圖繪制
(3)聚類熱圖繪制
14、GO、KEGG功能富集分析及結(jié)果可視化:
(1)GO富集分析
(2)KEGG富集分析
(3)富集分析氣泡圖繪制
理論+實操
第三天 基于公共數(shù)據(jù)的Biomarker挖掘鑒定演練(二) 15、預(yù)后相關(guān)性分析、生存曲線、ROC曲線繪制:
(1)利用R包進行單因素及多因素預(yù)后分析
(2)生存曲線繪制、生存曲線差異顯著性分析
(3)RISK score計算及結(jié)果可視化
理論+實操
基于公共數(shù)據(jù)的Biomarker挖掘鑒定演練(三) 16、利用string數(shù)據(jù)庫查詢基因/蛋白相互作用
17、網(wǎng)絡(luò)拓撲結(jié)構(gòu)分析、關(guān)鍵基因識別
理論+實操
基于公共數(shù)據(jù)的Biomarker挖掘鑒定演練(三) 18利用cytoscape工具構(gòu)建相互作用網(wǎng)絡(luò) 實操
第四天 多組學(xué)數(shù)據(jù)聯(lián)合分析演練(一) 19、表觀組高通量數(shù)據(jù)原理
20、甲基化與轉(zhuǎn)錄組整合分析思路
21、表觀組公共數(shù)據(jù)庫:ENCODE、regulomeDB
理論
多組學(xué)數(shù)據(jù)聯(lián)合分析演練(一) 22、甲基化數(shù)據(jù)預(yù)處理
23、差異甲基化位點及區(qū)域識別
24、差異分析結(jié)果可視化
實操
多組學(xué)數(shù)據(jù)聯(lián)合分析演練(二) 25、lncRNA-miRNA-mRNA全轉(zhuǎn)錄組整合分析思路演練
(1)lncRNA表達譜數(shù)據(jù)獲取
(2)miRNA靶基因分析
(3)lncRNA與mRNA表達相關(guān)性分析
(4)ceRNA網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建及結(jié)果可視化
理論+實操

注:內(nèi)容以實際發(fā)生為準;若調(diào),會提前通知。

報名費用

注冊費:4800元/人(含當(dāng)期聽課費、資料費、證書費、考試費(如有))。培訓(xùn)期間,食宿自理。

提供當(dāng)期視頻回放以供復(fù)習(xí)使用(羽林學(xué)院平臺)。

開具增值稅發(fā)票,提供蓋章通知、結(jié)業(yè)證書等相關(guān)材料。

報名優(yōu)惠政策

1、3人以上團體報名每人可減少300元;

2、4+1團報,可免費贈送一個名額;

3、上面優(yōu)惠政策不能同時享受,只能享受其中一種;

老學(xué)員參加及推薦學(xué)員參加均可額外優(yōu)惠200元。

培訓(xùn)以收到學(xué)員培訓(xùn)費為成功報名,培訓(xùn)座位按收到費用先后順序安排。

付費方式

現(xiàn)金、支票、銀行轉(zhuǎn)賬、銀行匯款、現(xiàn)場刷卡

單位全稱:北京市計算中心有限公司

賬號:0200151819100023937

開戶銀行:中國工商銀行股份有限公司北京永豐支行

(匯款信息備注:“生物計算——您的姓名”,個人匯款請備注單位名稱)

注:款項支出后,請?zhí)峁└犊罨貓?zhí)給工作人員,方便核實到賬、開具發(fā)票。

咨詢請聯(lián)系

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