2023.8.23-25|轉(zhuǎn)錄組學專題實戰(zhàn)班
近年來，隨著高通量測序技術(shù)的迅猛發(fā)展，轉(zhuǎn)錄組研究從以前的微陣列技術(shù)，SAGE及MPSS技術(shù)的低通量模式切換至RNA-seq的高通量模式。轉(zhuǎn)錄組學作為一個伴隨高通量測序技術(shù)率先發(fā)展起來的技術(shù)開始在生物學前沿研究中得到了廣泛的應(yīng)用。RNA-seq對于真核生物的基因表達調(diào)控，癌癥等疾病的發(fā)生機制和新治療方案確定，遺傳育種等眾多方面的研究具有不可估量的潛力。為了輔助廣大科研工作者掌握轉(zhuǎn)錄組高通量測序技術(shù)原理、實驗設(shè)計以及后期數(shù)據(jù)分析技能，舉辦“轉(zhuǎn)錄組學”專題實戰(zhàn)班。歡迎報名參加。更多消息可關(guān)注“生信會議”公眾號，會給您帶來更多驚喜！
主辦單位：北京市計算中心有限公司
協(xié)辦單位：
北京市基因測序與功能分析工程技術(shù)研究中心
云計算關(guān)鍵技術(shù)與應(yīng)用北京市重點實驗室
工業(yè)和信息化人才培養(yǎng)工程培訓(xùn)基地
北京市大數(shù)據(jù)教學實踐基地
支持單位：
肽度TIMEDOO
舉 辦 地：北京市海淀區(qū)豐賢中路7號北科產(chǎn)業(yè)3號樓
課程安排：2023年8月23-25日（周三-周五）??上9:30-11:30 下13:30-17:00
| 日期 | 主題 | 內(nèi)容 | 備注 |
| 第一天 | 轉(zhuǎn)錄組學前沿概述及測序原理 | 1.轉(zhuǎn)錄組技術(shù)發(fā)展前沿動態(tài)
2.轉(zhuǎn)錄組應(yīng)用案例及應(yīng)用熱點 3.常用的轉(zhuǎn)錄組實驗設(shè)計及測序建庫技術(shù) 4.單細胞轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù) 5.轉(zhuǎn)錄組技術(shù)流程及技術(shù)細節(jié) |
理論 |
| Linux服務(wù)器使用入門 | 1.掌握Linux系統(tǒng)下的常用命令（重點講解）
2.掌握Linux環(huán)境下軟件的安裝使用 3.了解Shell腳本的編寫 |
上機操作 | |
| 第二天 | 轉(zhuǎn)錄組分析方法 | 1.差異表達基因的功能分析（重點講解） | 理論 |
| De novo轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析上機實踐 | 1.原始測序數(shù)據(jù)的檢測和預(yù)處理（重點講解）
2.使用Trinity拼接轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)（重點講解） 3.原始數(shù)據(jù)與拼接轉(zhuǎn)錄本的比對（重點講解） 4.表達量統(tǒng)計和差異表達分析（重點講解） 5.使用blast對轉(zhuǎn)錄本進行功能注釋（重點講解） 6.尋找轉(zhuǎn)錄本的ORF，翻譯蛋白質(zhì)序列 7.轉(zhuǎn)錄因子注釋 |
上機操作 | |
| Reference based轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析
上機實踐（一） |
1.轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)準備和軟件介紹
2.使用HISAT進行轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的比對（重點講解） 3.用IGV查看比對結(jié)果 4.使用cufflinks進行表達量估計和分析（重點講解） 5.使用samtools檢測轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中的突變（重點講解） |
上機操作 | |
| 第三天 | Reference based轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析 | 1.lncRNA的定義、應(yīng)用和發(fā)展
2.lncRNA的生物學過程 3.lncRNA研究的實驗設(shè)計及測序原理 4.lncRNA測序分析結(jié)果解讀 |
理論 |
| Reference based轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析
上機實踐（二） |
1.利用tophat和cufflinks組合，預(yù)測轉(zhuǎn)錄本
2.使用CNCI預(yù)測新的lncRNA轉(zhuǎn)錄本（重點講解） 3.使用LncTar軟件預(yù)測lncRNA調(diào)控的靶基因（重點講解） |
理論+
上機操作 |
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| microRNA測序與數(shù)據(jù)分析 | 1.microRNA的定義、應(yīng)用和發(fā)展
2.microRNA的生物學過程 3.microRNA研究的實驗設(shè)計及測序原理 |
理論 | |
| microRNA測序與數(shù)據(jù)分析（包含上機實踐） | 1.microRNA測序數(shù)據(jù)分析軟件（重點講解）
2.microRNA測序數(shù)據(jù)預(yù)處理（重點講解） 3.microRNA的預(yù)測（重點講解） 4.microRNA靶標基因預(yù)測，結(jié)果提取、統(tǒng)計（重點講解） |
理論+
上機操作 |
注：內(nèi)容以實際發(fā)生為準；若調(diào)，會提前通知。
【報名費用】
【報名優(yōu)惠政策】
1、3人以上團體報名每人可減少300元；
2、4+1團報，可免費贈送一個名額；
3、上面優(yōu)惠政策不能同時享受，只能享受其中一種；
老學員參加及推薦學員參加均可額外優(yōu)惠200元。
【掃碼報名】
【咨詢請聯(lián)系】
【注】開課前一周會發(fā)送郵件通知；若未接到郵件通知，請電話咨詢。
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