cGAS-STING通路是負責識別胞質DNA免疫應答的主要通路1。cGAS作為胞質DNA受體,可以被DNA和/或Mn2+激活并利用ATP和GTP合成第二信使2’3′-cGAMP,后者進一步激活STING并誘導I型干擾素等細胞因子的產生,從而介導抗感染/腫瘤免疫反應。研究表明,多種病原微生物入侵及各種壓力脅迫,如氧化應激、代謝紊亂及DNA損傷等都可導致胞質DNA的累積及Mn2+濃度的升高,從而激活cGAS-STING通路。因此,cGAS-STING信號通路在抵抗病原微生物感染、腫瘤及多種免疫相關疾病的發(fā)生及治療中都發(fā)揮關鍵作用。

磷脂酰肌醇磷酸(phosphoinositides,PIPs)是構成真核生物細胞膜組分的重要磷脂(占總磷脂的5—10%),也是重要的信號分子2。由于肌醇六元環(huán)上D-3、D-4或D-5位都可發(fā)生磷酸化修飾,因此真核生物中總共存在7種不同PIP分子。PI4P(phosphatydyinositol 4-phosphate)是胞內含量最高的PIP分子,廣泛分布于各種膜組分,且在反式高爾基體(trans-Golgi network,TGN)上的含量最高。細胞中的PI4P的含量主要受其合成酶PI4Ks(PI4KA、PI4KB、PI4K2A和PI4K2B)和降解酶SAC1的調控。PI4P不僅是合成PIP2和PIP3的前體,也是重要的信號分子,在膜泡運輸、脂質轉運和細胞器形態(tài)維持等方面發(fā)揮關鍵作用。

2021年,北京大學生命科學學院/北大-清華生命科學聯(lián)合中心的蔣爭凡教授實驗室利用STING自激活突變體誘導細胞死亡的特性,在HT080細胞中進行了基于CRISPR-Cas9介導的全基因組篩選,發(fā)現(xiàn)高爾基體腔內合成的硫酸化糖胺聚糖(sGAGs)可以通過結合到STING跨膜區(qū)的腔內側,從而誘導STING的寡聚及激活3。該論文的討論部分提到STING和sGAGs的相互作用受到STING腔內側pH值的調控,并由此推測STING在pH更低的后高爾基體囊泡(post-Golgivesicles)中會有更高的活性。但是在這項研究中,他們沒有解釋STING為什么需要及如何轉運到后高爾基體囊泡。

2023年3月14日,蔣爭凡實驗室在Immunity上以research article形式在線發(fā)表了題為“ARMH3-mediated recruitment of PI4KB directs Golgi-to-endosome trafficking and activation of the antiviral effector STING”的論文,報道了ARMH3作為接頭蛋白招募PI4KB到STING,PI4KB通過合成PI4P促進STING從高爾基體到內體的轉運(Golgi-to-endosome trafficking)及維持STING激活所需要的脂膜環(huán)境(lipiden vironment),從而幫助STING更加穩(wěn)定高效地激活。

本工作首先通過CRISPR-Cas9介導的全基因組篩選在HeLa細胞系中鑒定到一個未知功能的新基因C10ORF76(又名ARMH3)對STING的激活十分重要(圖一A)。ARMH3是一個鮮少被研究的蛋白,為數(shù)不多的幾篇文章暗示了它對于PI4KB發(fā)揮激酶活性來磷酸化磷脂酰肌醇(phosphatidylinositol,PI)生成PI4P十分重要。免疫熒光實驗發(fā)現(xiàn)STING激活后和ARMH3、PI4KB及PI4P都在反式高爾基體有明顯的共定位。進一步免疫共沉淀實驗顯示,STING只有在ARMH3存在的情況下和PI4KB有互作(圖一B),表明ARMH3在STING和PI4KB之間起到橋梁作用。進一步實驗表明,ARMH3分別結合位于STING第二、三跨膜區(qū)之間的連接區(qū)域及位于PI4KB激酶結構域中間的連接區(qū)域。突變掉STING負責結合ARMH3的氨基酸或者利用CRISPR-Cas9原位刪除PI4KB與ARMH3互作的關鍵區(qū)域(6個氨基酸殘基)都會顯著削弱cGAS-STING通路的激活。這些結果表明,ARMH3招募PI4KB對于STING的激活十分關鍵。更重要的是,細胞內敲除ARMH3或者原位刪除PI4KB結合ARMH3所需的6個氨基酸,STING在上游通路活化后幾乎呈現(xiàn)完全的內質網定位,暗示如果2’3′-cGAMP結合后被轉運到高爾基體的STING無法被繼續(xù)轉運到后高爾基體囊泡,將會被細胞內COPI/AP1介導的從高爾基體向內質網的逆向轉運運回內質網,并完全抑制STING的活化。

北京大學生命科學學院蔣爭凡課題組發(fā)現(xiàn)STING后高爾基體囊泡轉運的重要性及分子機制-肽度TIMEDOO

為了更直接地研究PI4KB對STING激活的影響,研究者使用雷帕霉素誘導的FKBP和FRB相互作用,直接招募PI4KB-GFP-FKBP到STING-mCherry-FRB,并發(fā)現(xiàn)招募PI4KB到STING會顯著促進STING聚集體的形成及下游信號通路的激活(圖一C),且這種對于STING通路的激活能力完全依賴于PI4KB的激酶活性。相反,招募PI4P的磷酸酶SAC1到STING則會抑制STING聚集體的形成及下游信號通路的激活。表明PI4KB通過在STING周圍合成PI4P促進STING的激活。有趣的是,SAC1的敲低會引起細胞內PI4P水平的異常升高,進而導致STING不依賴于cGAS的自激活。TMEM39A是一個自身免疫性疾病相關基因且被報道參與細胞內的PI4P水平的調控4。同樣,TMEM39A的敲低也會導致細胞內PI4P的水平的異常升高及STING的自激活,該發(fā)現(xiàn)有助于理解TMEM39A相關自身免疫疾病的致病機制。此外,SCAP 和NPC1的突變也被報道可以引起細胞內PI4P的水平的異常升高及STING的自激活5—8,提示胞內PI4P水平的異常升高可能是這些基因突變導致STING自激活的共同原因。

為了研究PI4P如何影響STING的激活,研究者對23個PI4P結合蛋白進行了系統(tǒng)性的敲低并發(fā)現(xiàn)其中9個成員的降低表達會使STING的激活嚴重受損(圖一D)。功能分析表明,這9個PI4P結合蛋白可以分為兩類。其中AP-1和GGA2負責介導高爾基體到內體的膜泡運輸。由于內體中相對更低的pH值有利于STING與sGAGs的結合,他們推測PI4P可以通過指導AP-1和GGA2介導的clathrin-coated vesicles (CCVs)將STING從高爾基體轉運到內體從而避免STING被運回內質網,并且更加強烈激活STING。另一類PI4P結合蛋白均為脂質轉運蛋白,其中OSBP和ORPs負責從內質網向高爾基體或內體轉運膽固醇,CERT負責神經酰胺從內質網到高爾基體的轉運。神經酰胺在高爾基體上會在SGSM1的催化下轉化為鞘磷脂,且SGSM1在細胞內的敲除會顯著削弱STING的激活,提示鞘磷脂而非神經酰胺直接作用于STING。通過特異的化學小分子破壞膽固醇和鞘磷脂在脂膜上的分布會使STING聚集體逐漸消散并顯著抑制STING下游信號通路的激活,表明膽固醇和鞘磷脂對STING聚集體的形成和激活十分關鍵。以上結果共同表明,PI4P還可以通過脂質轉運蛋白維持STING活化所需的脂膜環(huán)境進而影響STING的激活。此外,Lyz-Cre介導的Armh3條件敲除小鼠實驗表明Armh3在機體對抗DNA病毒感染過程中發(fā)揮關鍵作用。

北京大學生命科學學院蔣爭凡課題組發(fā)現(xiàn)STING后高爾基體囊泡轉運的重要性及分子機制-肽度TIMEDOO

綜上所述,該研究發(fā)現(xiàn):1)STING為什么需要離開及如何離開高爾基體【后高爾基體轉運(post-Golgi trafficking)】的分子機制(圖二);2)一個功能未知蛋白ARMH3(可能還具有GEF活性,激活膜泡轉運中非常重要的Small GTPase Arf1)在cGAS-STING通路中的重要作用;3)脂膜環(huán)境對STING的活化十分關鍵;4)細胞內PI4P水平的異常升高可以導致非依賴于cGAS的STING分子自激活(cGAS-independent STING autoactivation)。重要的是,這種現(xiàn)象在很多脂質代謝紊亂的自身免疫病患者中被發(fā)現(xiàn)及報道。鑒于PI4P在脂質運輸及脂質穩(wěn)態(tài)維持中的核心作用,該研究還提示,STING作為一個潛在的細胞脂質穩(wěn)態(tài)感受器(lipid homeostasis sensor),可能是細胞內的一種新型危險信號感受器。

北京大學生科院博士后方潤和蔣啟飛為該文章的共同第一作者,2022級研究生賈新穎也為本研究作出貢獻。蔣爭凡為通訊作者。本研究工作得到了國家自然科學基金委、科技部國家重點基礎研究項目、北京大學“細胞增殖與分化”教育部重點實驗室及北大-清華生命科學聯(lián)合中心的資助。

參考文獻

1. Fang, R.et al. Recent advances in the activation and regulation of the cGAS-STING pathway. Advances in Immunology?156, 55—102, doi:10.1016/bs.ai.2022.09.003 (2022).

2. Posor, Y. et al.Phosphoinositides as membrane organizers. Nat Rev Mol Cell Biol, doi:10.1038/s41580-022-00490-x (2022).

3. Fang, R. et al. Golgi apparatus-synthesized sulfated glycosaminoglycans mediate polymerization and activation of the cGAMP sensor STING. Immunity?54, 962—975, doi:10.1016/j.immuni.2021.03.011 (2021).

4. Miao, G. et al. The ER-Localized Transmembrane Protein TMEM39A/SUSR2 Regulates Autophagy by Controlling the Trafficking of the PtdIns(4)P Phosphatase SAC1. Mol Cell?77, 618—632 e615, doi:10.1016/j.molcel.2019.10.035 (2020).

5. Wakana, Y. et al. The ER cholesterol sensor SCAP promotes CARTS biogenesis at ER-Golgi membrane contact sites. J Cell Biol 220, doi:10.1083/jcb.202002150 (2021).

6. Kutchukian, C. et al. NPC1 regulates the distribution of phosphatidylinositol 4-kinases at Golgi and lysosomal membranes. EMBO J 40, e105990, doi:10.15252/embj.2020105990 (2021).

7. York, G. et al. Limiting Cholesterol Biosynthetic Flux Spontaneously Engages Type I IFN Signaling. Cell 163, 1716—1729, doi:10.1016/j.cell.2015.11.045 (2015).

8. Chu, T. et al. Tonic prime-boost of STING signalling mediates Niemann-Pick disease type C. Nature 596, 570—575, doi:10.1038/s41586-021-03762-2 (2021).

來源:北京大學